公园总面积1045平方公里,共分为8大园区,分别是周口店北京人遗址科普区、石花洞溶洞群观光区、十渡岩溶峡谷综合旅游区、上方山—云居寺宗教文化游览区、圣莲山观光体验区、百花山—白草畔生态旅游区、野三坡综合旅游区、白石山拒马源峰丛瀑布旅游区。
根据地质遗迹类型及分布特点,中国房山世界地质公园确定了1个中心、1条生态走廊和8个园区的布局模式,即地质公园综合服务中心、拒马河生态走廊、周口店北京人遗址园区、石花洞园区、十渡园区、上方山-云居寺园区、圣莲山园区、百花山-白草畔园区、野三坡园区、白石山园区。
中国房山世界地质公园共有国家级重点保护野生动物18种,其中国家一级重点保护野生动物4种,国家二级重点保护野生动物14种,北京市级保护动物50余种。